ACEMD

ACEMD

原廠網址: http://multiscalelab.org/acemd 

這是一套以GPU為基礎的超快的平行計算軟件

並且支持charmm，amber，NAMD的文件格式，用GPU並行處理。 運行速度驚人。

學術用戶450歐元license per year。 是有些貴，不過很想體會一下極限速度。

鴻鵠國際是中國區域官方合作廠商，我們提供技術支持與軟體銷售，並且提供收費教育訓練課程   gpu.honghutech.com 

多尺度的實驗室(Multiscable lab)主要集中在通過不同尺度的相互作用產生的物理現象，例如（尺度）之間的單分子和收集範圍。multiscalelab設在巴塞羅那生物醫藥研究園（PRBB） 。

我們使用的主要是加速處理器（圖形處理單元（GPU）的http://www.gpugrid.net）和加速分子動力學程序ACEMD研究大分子動力學和熱力學。模擬的蛋白質，可以直接增加的生物活性的分子機制，我們的知識和實驗的科學家從分子，更根本的角度理解一個實驗。