Molegro Virtual Docker為藥物輔助設計軟件 Molegro Virtual Docker 可以跨平台使用（Linux，Windows和Mac的 網站的預測以及最後更新的小分子的結合及構造 虛擬優化技術。 Molegro Virtual Docker (MVD)的對接精度高於其它先進的對接產品MVD: 87%, Glide: 82%, Surflex: 75%, FlexX: 58%) 鴻鵠國際為台灣地區官方合作廠商，並且可提供技術支援與收費的教育訓練。 我們從事基礎人工智能技術的開發工作。所有技術，從語音識別到計算機視覺、自然語言處理、數據倉庫、用戶理解，我們用人工智能技術支持很多國際業務並孵化新業務方向。 鴻鵠國際股份有限公司 業務窗口 蔡先生 歡迎來電或來信諮詢。  總覽 Molegro虛擬Docker是用於預測蛋白質與配體相互作用的集成平台。Molegro Virtual Docker處理對接過程的所有方面，從分子的製備到目標蛋白潛在結合位點的確定以及配體結合模式的預測。 Molegro虛擬Docker基於一種新穎的優化技術以及結合了可用性和生產力的用戶界面體驗，提供了高質量的對接。 與其他最先進的對接產品（MVD：87％，Glide：82％，Surflex：75％，FlexX：58％）相比，Molegro虛擬Docker（MVD）具有更高的對接精度。 Molegro虛擬Docker提供 對接精度高：對接引擎已被證明可以正確正確識別綁定模式。在識別正確的綁定模式方面，Molegro Virtual Docker的性能優於其他對接程序（有關更多信息，請參見MVD參考頁）。 易於使用的界面：內置的嚮導使用戶可以輕鬆設置和執行對接運行。提供了先進的可視化和分析工具，以檢查配體-受體相互作用並微調找到的對接溶液。 ======== 分子的導入與製備 易於導入和製備分子。 分子結構文件被解析為相關組件（配體，輔因子，水分子和蛋白質），並且可以自動製備。 解析警告和錯誤以方便的層次結構顯示。  MVD檢測鍵，芳香性，分配電荷並添加明確的氫。 ==== 內置的空腔檢測器可識別有希望的結合位置，從而可以將搜索空間限制在最有趣的區域。 一個 質子化嚮導， 使您能夠快速識別潛在的質子化目標（如組氨酸殘基），並使用上下文菜單迅速改變其質子化狀態。  使用質子化指南自動檢測和質子化蛋白質。 對接 停靠過程通過停靠嚮導進行管理。該嚮導使您可以： 選擇要包括在模擬中的結構。 選擇潛在的綁定區域（MVD將自動顯示潛在的綁定口袋）。 配置搜索算法屬性，並設置群集和數據記錄。 管理其他約束。 檢查有關不太可能的準備工作和缺少結構信息（例如未知殘留物）的警告。  運行對接嚮導的各個步驟。 分析 姿勢管理器允許您瀏覽對接引擎返回的姿勢。它能夠動態加載來自對接運行的姿勢，從而可以瀏覽數千個配體。 可以檢查各種能量項和相互作用，還可以計算更高級的重新排名和綁定親和力度量。在姿勢之間切換時，氫鍵和靜電相互作用會動態更新。  姿勢組織者。 序列和結構可視化 序列查看器使您可以快速識別和選擇蛋白質中的殘基。 卡通可視化突出顯示了二級結構的不同區域。  結構可視化。 約束條件 各種 約束 使得可以改變能量格局（例如，通過獎勵搜索空間的某些區域）或強製或防止某些相互作用的發生。 可以基於化學性質（例如氫鍵受體或環原子）定義約束，也可以為每個配體指定單獨的原子。  約束條件。 數據建模與分析 與MVD捆綁在一起的“ Molegro Data Modeller”產品使創建回歸和分類模型，提取統計量以及可視化數據成為可能。 通過MVD對接運行預測對接化合物的數值特性。用戶創建的模型可以直接在Pose Organizer中應用。 使用導入的數字描述符（例如，從第三方軟件）創建回歸模型。 用於選擇相關描述符的特徵選擇。 代數數據轉換插件，用於處理描述符或創建派生的描述符。 1D圖（直方圖），2D圖（XY圖）和3D圖。 各種統計指標。  使用Molegro Data Modeller進行數據建模和分析。 側鏈靈活性 在MVD中，通過在對接過程中軟化電位（通過增加PLP電位的耐受性或通過減弱選定的側鏈相互作用），對接不同的姿勢組並最終優化側鏈配置來實現側鏈靈活性。也可以手動最小化受體結構。 對接模擬完成後，可以直接在姿勢組織器中同時檢查找到的姿勢及其匹配的受體構象。  側鏈靈活性。 模版對接 MVD使得可以將配體停靠在 對接模板上。與藥效團相似，模板是根據相關的化學性質（如電荷和氫鍵能力）構建的，可以從一種或多種配體構象自動生成。模板可以以多種方式使用： 靈活排列多個配體（並確定它們的相似性得分）。 通過將模板相似性得分與基於受體的對接評分功能相結合來集中或指導對接模擬。 要從每個模板點提取細粒度的相似性分數，並使用Molegro Data Modeller（3D QSAR）創建回歸模型。  模版對接。 其它功能 KNIME工作流程支持。 可定制的 分子表面 和 主鍊 錶示。 用於包含對稱轉換信息的PDB文件的生物分子生成器。 用於各種分子特性的高級 文本標籤。 PDF用戶手冊中的廣泛幫助 和自動檢查更新。 MVD可以使用其自己的 腳本語言 或外部腳本語言來編寫腳本。 姿勢修改器， 用於手動修改姿勢。 具有內置編輯器的可擴展和可自定義的 宏系統(macro system)。 請參閱 用戶手冊 ，以更全面地了解Molegro Virtual Docker功能。 ======== 以下舊的訊息
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